Bozdoğan Su kemeri bitişiğinde bulunan Ayios Theodoros ( Theotokos Kyriotissa )Kilisesi olarak 10-12. yüzyılda inşa edildiği tahmin edilen bu camii 18. yüzyılın ilk yarısındaBabüssaade Ağası Maktul Beşir Ağa tarafından camiye dönüştürülmüştür.
Yunan Haç planına göre inşa edilen eserin yan tarafında harabe halini almış olan tarihi duvar kalıntıları bulunmaktadır .
Kronolojisi :
10-12 yy.
Ayios Theodoros Kilisesi olarak inşa edildi
1204-61
Bugün varolmayan manastırı ile birlikte Patrikhane olarak kullanıldı
1453 sonrası
Zaviyeye dönüştürülerek Kalenderi Tarikatına tahsis edildi
18 yy.
Babüssaade Ağası Maktul Beşir Ağa tarafından camiye dönüştürüldü
1854
Yıldırım düşmesi sonucu Minaresi yıkıldı
1930
Büyük bir yangından sonra tadilat geçirdi
1966-75
Harvard üniversitesi ve İTÜ tarafından Camii etrafında kazı çalışmaları yapıldı